Henüz lise yıllarında iken amatör olarak uçmaya başlayan, 1962-1963 yıllarında Türk Hava Kurumu’nda çok sayıda uçuş yapan Burhan Güngör, daha Sonra Türk Hava Kuvvetleri’ne girdi. Hava Kuvvetleri’nde F-84 uçaklarında uçan Güngör, 1965 yılında Hava Kuvvetleri'nden mezun oldu. Bundan sonra İzmir Çiğli’ye giden Burhan Güngör, burada 9 yıl görev yaparak, T-33 uçaklarında yüzlerce öğrenci yetiştirdi.
Bir süre Pakistan’da askeri ateşelik yapan Güngör Hoca, Malatya 172. Filoda en büyük aşkı F-4 uçaklarında uçtu. Çok erken yaşta kaptan brövesi alan Burhan Güngör, Malatya 172. Filo’dan biraz daha rahat bir görev için İstanbul Yeşilköy Hava Harp Okulu’na geçti.
Hava Kuvvetleri’nde henüz binbaşı olmadan kaptan brövesi alan Güngör Kaptan, Hava Kuvvetleri’nden emekli olarak Türk Hava Yolları’na geçti. THY’de Fokker tipi uçaklarda uçmaya başlayan Burhan Güngör sırasıyla DC-9, Boeing- 727, Airbus-300, Airbus 310 ve son olarak uzun bir süre Airbus 340’larda uçtu.
'Hocaların Hocası' olarak bilinen, gerek Türk Hava Kuvvetleri, gerekse THY’de yüzlerce pilot yetiştiren Burhan Güngör, pilot camiasında insanlığı, dürüstlüğü ve kişiliği ile her zaman örnek alındı.
Burhan Güngör, yakalandığı akciğer kanserinden kurtulamayarak 65 yaşında Antalya’da hayata gözlerini yumdu.